以计划为基础的工程进度控制
《普捷工程项目管理系统》的进度控制是以计划为基础的，在 两级业主协同工作时，两级业主都需要制订自己的工作计划。同时两级业主的工作计划还需要体现工作分工的平行关系及上下级隶属汇总的协同工作关系。从业主代表与外延单位来看，网络计划需要首先由业主代表提供大画面，需要从业主代表到施工标段逐级细化，逐级分配任务的划整为零 (计划)及逐级上报汇总，集零为整（进度）的协同工作方式。同时系统还应支持由业主代表主控的滚动计划。
系统中工程网络图是工程项目进度计划和实际进度控制的工具，也是描述工程进度的语言。所有的任务分解和汇总都通过工程网络图完成，对于未开工的任务在工程网络图中以计划的形式体现，已完成的任务即是工程的实际进度。
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按权重进行项目进度汇总
在工程进度管理中，通常使用进度百分比描述工程的进度。对于工程建设任务的工程量，一般按工时法进行表述。但在以里程碑任务为主的任务中，如物资采购任务，则无法使用工时法描述进度的百分比。在进行多项目、多任务的汇总时，由于各个子工程使用的日历、工期计算方法不同，汇总得到的进度百分比与实际工程的总完成量会有误差。为了解决这个问题 《普捷工程项目管理系统》引入了任务和子工程的工程量权重机制。在系统建立模型时根据行业、地区以及工程性质确定每个任务在工程中的工程量权重，和每个子工程在整个工程中的工程量权重，系统按照各任务和子工程的工程量权重进行工程进度计算。
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以挣得值法为原则的投资管理
企业工程项目的资金管理分为业主投资控制管理和承建单位费用管理。业主关心的是投资完成的情况和实际的资金支出。 《普捷工程项目管理系统》用 计划完成投资累计、实际投资完成累计、支付金额累计 3个指标实现对工程项目的资金控制。这3个指标对应 挣得值法中的 BCWS 计划工程投资额、 BCWP 实际工程投资额、 ACWP 消耗工程投资额，按照 挣得值法的分析方法可以得到进度偏差、费用偏差、 支付比例等数据和图表，利用这些数据对项目的资金运作情况进行分析和控制。
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以工作流为载体的日常工程管理
企业工程项目管理的日常工作实际上是团队中进行的数据流转过程和任务的执行过程。 《普捷工程项目管理系统》的工作流程是在虚拟团队中进行的“系统文件”（系统中具有工程管理含义的数据格式）起草、传递、审批过程， 工作流程功能支持按工作任务事先设置好的固定流程自定义流程，流程的节点是具体的业务处理部门，流程启动时由流程提出方确定具体人员。工作流程功能支持跨服务器的流程和具有待办工作通知功能，配合分类视图能清楚地了解自己待办的工作和任务完成情况。
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以四控制两管理为要素的任务分段管理
《普捷工程项目管理系统》根据企业工程项目管理的特点，管理要素包括 进度控制、投资控制、质量控制、安全控制和合同管理、综合信息管理。管理要素贯穿工程项目管理的各项工作和整个过程。
为了使项目各阶段的管理更清晰和实现项目各阶段管理的工作交接， 《普捷工程项目管理系统》支持工程任务分段管理，在制定工程项目的整体计划时对项目任务进行分段，每段任务可以有多项任务，每项任务的作业分类可以是一个合同、也可以是一项内部任务。每项任务都对应一个进度计划和实时进度上报。在电力建设工程的管理中，任务分为 7个阶段； 前期工作、项目设计、物资采购、线路施工、土建施工、电气安装、项目验收。
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多项目进度、资金的预警机制
《普捷工程项目管理系统》 系统实现了对多项目的预警汇总机制。
进度预警系统是《普捷工程项目管理系统》的一个工程进度控制工具，进度预警根据系统建模时给定的条件，在进行项目进度汇总时自动的分析进度情况，并对有差异的项目出示预警信息。
《普捷工程项目管理系统》的进度预警机制是以项目为基础、以一个时间点基准，对项目工程的各个阶段进行预警提示。在电网建设管理系统中，系统对前期工作进度、项目设计进度、物资采购进度、线路施工进度、土建施工进度、电气安装进度、项目验收进度进行预警监测。告警分三级，分别用不同颜色的指示灯表示，分别为正常（绿色）、严重告警（红色）、一般告警（黄色）。
资金预警系统根据系统建模时给定的条件，在进行项目投资完成情况汇总时自动的分析资金情况，并对有差异的项提示预警信息。
《普捷工程项目管理系统》的资金预警机制是以项目为基础、以一个时间点基准，对资金支付、投资完成、资金到位、支付比例进行预警监控。
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兼容多种链路形式的数据传递结构
《普捷工程项目管理系统》是一个在局域网和广域网上运行的软件，除集团公司、建设单位子系统必须运行在局域网中外，各子系统之间的链接可以采用多种链路形式。系统支持电话线拨号的 MODEM传输方式，在这种链路结构下系统能实现基本的管理功能。使用ADSL等Internet高速链路和DDN等专用链路时，系统能稳定的工作。使用企业内部高速网络时，系统的工作效率更高，工作更稳定、安全。